避孕失败后孕育的胎儿通常不会因避孕措施本身导致畸形，但胎儿健康可能受药物成分、避孕方式及母体健康状况影响。
避孕失败后怀孕的胎儿畸形风险主要与使用的避孕方法有关。短效避孕药的主要成分为雌激素和孕激素，若在服药期间意外怀孕，药物可能干扰胚胎早期发育，但现有研究未明确证实其直接导致胎儿结构异常。宫内节育器避孕失败时，节育器可能增加宫外孕概率，但不会直接引发胎儿畸形。屏障避孕法如避孕套、隔膜等失败后，对胎儿发育无负面影响。紧急避孕药含大剂量孕激素，若避孕失败且妊娠继续，目前尚无证据表明其与胎儿畸形存在必然关联。
少数情况下，若长期服用某些特定类型避孕药或使用含铜宫内节育器后妊娠，可能因激素持续作用或宫腔环境变化间接影响胎儿。例如长期服用高效孕激素避孕药可能干扰子宫内膜容受性，而铜离子释放可能改变输卵管微环境。但这些情况导致的胎儿异常概率极低，且多与母体本身存在的生殖系统疾病或遗传因素共同作用相关。
建议避孕失败后继续妊娠者及时进行产前检查，包括孕早期超声筛查和妊娠11-13周的NT检查。孕期需避免接触致畸物质，补充叶酸等营养素。若曾使用激素类避孕药，应告知医生具体药物名称和使用时间，以便评估个体风险。定期产检可有效监测胎儿发育情况，多数避孕失败后妊娠的胎儿能健康出生。
