多数肛瘘需要手术治疗才能根治。肛瘘的治疗方式主要有手术切除、挂线疗法、瘘管切开术、生物胶封堵术和保守观察，其中手术是解决肛瘘最有效的方法。
1、手术切除：
手术切除是治疗肛瘘的经典方法，通过完整切除瘘管和感染组织达到根治目的。适用于单纯性低位肛瘘，术后复发率低于5%。手术创面需每日消毒换药，2-3周可愈合。
2、挂线疗法：
挂线疗法通过弹性线缓慢切割瘘管，形成新鲜创面后逐步愈合。适用于高位复杂性肛瘘，可避免肛门括约肌损伤。治疗周期约4-6周，需定期门诊收紧挂线。
3、瘘管切开术：
将瘘管全程切开形成开放创面，通过肉芽组织生长实现愈合。适用于低位经括约肌肛瘘，术后需坚持坐浴和创面护理。愈合时间较切除手术延长1-2周。
4、生物胶封堵：
采用医用生物胶封闭瘘管内口，刺激组织再生修复。适用于单纯性肛瘘初发患者，创伤小但复发率较高。术后24小时需保持俯卧位避免胶体移位。
5、保守观察：
无症状的单纯性低位肛瘘可暂缓手术，通过高锰酸钾坐浴和抗生素控制感染。但约60%患者最终仍需手术治疗，保守期间需定期复查瘘管变化。
